Fundacja SYNAPSIS powstała w 1989r. Rok później miały miejsce pierwsze konsultacje dzieci chorych na autyzm. W okresie trzyletniej pracy wstępnej prowadziliśmy działania pilotażowe, szkolenia dla współpracowników, nauczycieli i rodziców. Dokonywaliśmy adaptacji metod terapeutycznych i edukacyjnych na potrzeby Programu Pomocy Dzieciom Autystycznym i Ich Rodzinom. W centrum naszego zainteresowania zawsze była i jest cała rodzina dziecka chorego na autyzm. We wrześniu 1993 roku powstał zespół terapeutów specjalizujących się w problematyce całościowych zaburzeń rozwoju dziecka.

Od początku zdawaliśmy sobie sprawę, że możemy objąć pomocą jedynie niewielką w stosunku do potrzeb, grupę dzieci i ich rodzin. Przez szereg lat wynajmowaliśmy pomieszczenia od ZOZ Mokotów. Podjęliśmy decyzję o pracy w systemie ambulatoryjnym. W 1999 roku, po latach starań, zbudowaliśmy w centrum Warszawy Ośrodek dla Dzieci z Autyzmem Fundacji SYNAPSIS, w którym objęlismy opieką ambulatoryjną 300 rodzin.

Teren na obrzeżu Pól Mokotowskich otrzymaliśmy od Dzielnicy Ochota Gminy Warszawa-Centrum.

Pierwszy pawilon Ośrodka powstał przede wszystkim dzięki dotacjom Państwowego Funduszu Rehabilitacji Osób Niepełnosprawnych. Znaczący udział w finansowaniu budowy Ośrodka miały również: Ministerstwo Edukacji Narodowej, Miasto Stołeczne Warszawa (Biuro Polityki Społecznej oraz Biuro Polityki Zdrowotnej) i Wojewódzki Zespół Pomocy Społecznej.

Gmina Warszawa-Centrum sfinansowała oczyszczenie terenu po dzikich działkach, zakup krzewów oraz założenie trawników.

Państwowy Fundusz Rehabilitacji Osób Niepełnosprawnych współfinansuje (w ramach 5-cioletniego Porozumienia)prowadzenie kompleksowej rehabilitacji dzieci z autyzmem i pokrewnymi zaburzeniami rozwoju oraz szkolenie rodziców, opiekunów i wolontariuszy do prowadzenia rehabilitacji leczniczej i społecznej dzieci z autyzmem oraz pokrewnymi zaburzeniami rozwoju w ich środowisku.

Wydział Spraw Społecznych Mazowieckiego Urzędu Wojewódzkiego i część gmin warszawskich pokrywają jedną trzecią kosztów leczenia "swoich" dzieci.

Specjalnie dla wspierania finansowego naszych zamierzeń powstała kapitałowa fundacja Fundusz Wieczysty Centrum Dziecięcego SYNAPSIS. Dary fundatorów tworząc kapitał podstawowy stanowią wieczyste źródło zasilania programu pomocy dzieciom z uszkodzeniami ośrodkowego układu nerwowego realizowanego przez Fundację SYNAPSIS.

W planach mamy dalszą rozbudowę Ośrodka oraz stworzenie w przyszłości ośrodka dziennego pobytu dla dzieci z terenu Warszawy.