Podstawową jednostką organizacyjną Przedszkola jest oddział obejmujący dzieci w zbliżonym wieku z uwzględnieniem ich potrzeb, zainteresowań, uzdolnień oraz poziomu funkcjonowania. Liczba dzieci w oddziale, zgodnie z potrzebami edukacyjnymi i terapeutycznymi dla dzieci z autyzmem oraz z wytycznymi Rozporządzenia Ministra Edukacji z 21.05.01r. (załącznik 1 do Rozporządzenia, § 5, ust.4, pkt.7), nie przekracza 4. Przedszkole przewidziane jest dla 28 dzieci z autyzmem, zgrupowanych w 7 oddziałach.

Placówka czynna jest od poniedziałku do piątku w godz. od 8.30 do 15.00. Rok szkolny w Przedszkolu rozpoczyna się z dniem 1 września każdego roku, a kończy się z dniem 31 sierpnia następnego roku, z przerwą w pracy na miesiące wakacyjne (lipiec, sierpień).

Programem wychowania przedszkolnego realizowanym w Pierwszym Niepublicznym Przedszkolu Terapeutycznym Fundacji SYNAPSIS jest program ,,Od przedszkolaka do pierwszaka" autorstwa Iwony Brody wydany przez Wydawnictwa Szkolne i Pedagogiczne.

Program jest zgodny z podstawą programową zatwierdzoną przez Ministra Edukacji Narodowej ( rozporządzenie z dnia 15 stycznia 2009 roku) oraz z Rozporządzeniem Ministra Edukacji Narodowej z dnia 8 czerwca 2009 roku w sprawie dopuszczania do użytku szkolnego programów wychowania przedszkolnego, programów nauczania i podręczników oraz cofania dopuszczenia.

Przedszkole mieści się w samodzielnym budynku na warszawskiej Sadybie przy ul. Powsińskiej 56. pierwszym. Placówka o powierzchni ok. 500 m kw. jest w pełni dostosowana do potrzeb dzieci z autyzmem – w salach obowiązuje minimalizm, brak jest ostrych kolorów i wzorzystych materiałów, pomoce dydaktyczne są schowane w szafkach. Taka aranżacja przestrzeni pozwala dziecku na pełniejsze korzystanie z zajęć oraz lepszy kontakt z nauczycielami i rówieśnikami.